Kursöversikt

Välkommen till BMA113 Molekylärbiologisk diagnostik av mikroorganismer 7,5 hp

 

Kursen går på kvartsfart under hösten 2020 med kursstart v 38, onsdag den 16/9 kl 14:30.

Zoomlänk till kursstart : https://gu-se.zoom.us/j/67684642531

Majoriteten av undervisningen kommer att vara förlagd på Klinisk mikrobiologi, Guldhedsgatan 10 A. Föreläsningar kommer att ske både live i föreläsningssal och via digital länk via verktyget zoom. Praktiska moment kommer att utföras på mikrobiologen.  Undervisningen kommer att ta ca en eftermiddag i veckan (vissa undantag)  i anspråk plus egenstudier och eget arbete. För schema klicka på schemalänken nedan.

Schema

Schema TimeEdit

 

 

Vid frågor om kursen, kontakta Erika Lindberg: erika.lindberg@gu.se

 

Kursens innehåll:

För att kunna använda lämplig molekylärbiologisk metodik krävs kunskap om mikroorganismers genetik, struktur, arvsmassa, replikering, transkription, translation, proteinsyntes, plasmider och transposoner.

Kursen går igenom olika extraktionsmetoder: DNA, RNA, manuell och automatiserad samt detektionsmetoder för nukleinsyror.

Molekylärbiologisk metodik som tas upp är PCR-baserade metoder så som tex revers transkriptas-PCR, realtids PCR och digital droplet PCR, design av primer och probe, Sanger sekvensering, next generation sequencing (NGS) och mutationsanalyser.

Epidemiologisk metodik som tas upp är pulsfältgelelektrofores (PFGE), sekvensering av protein A-genen (SPA), random amplified polymorphic DNA (RAPD), multi-locus sequence typing (MLST), NGS, multiple-locus variable number tandem repeat analysis (MLVA), terminal restriction fragment length polymorphism (TRFLP) och fylogenetiska analyser mfl för smittspårning.

Kursen fokuserar på kvalitetssäkring, problemlösning och felsökning och tar upp validering samt interna och externa kontroller.

Även metoddesign samt användning av databaser och internetverktyg är en del av kursen.

 

Kursadministration: Tizalech Ayele tizalech.ayele@gu.se

Länk till studentportalenLänkar till en externa sida.

 

Kursplan

Kurssammanfattning:

Datum Information Sista inlämningsdatum